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小米手机短信加密设置密码保护的步骤如下。
1、打开手机，找到并点击“设置”。
2、在设置中找到“应用锁”或者“应用隐私”选项，根据手机版本不同可能存在差异，点击进去。
3、进入应用锁或应用隐私后，可以看到拥有设置密码的选项，此时需要先设置一个隐私密码，用于后续应用锁的验证，可以选择数字或者图案密码。
4、设置完密码后，在应用列表里找到“短信”应用，将其设为加密状态，这样，进入短信应用就需要验证之前设置的密码了。
对于MIUI 11及之后的版本，也可以通过以下步骤设置私密短信：
1、打开短信应用。
2、在短信列表中，长按想要隐藏的短信会话或短信。
3、在弹出的菜单中，选择“加密”选项，此时会要求输入之前设置的隐私密码进行验证，完成验证后，所选的短信会话或短信就会被隐藏起来，查看这些隐藏短信时，需要再次输入密码。
不同版本MIUI系统的操作可能存在差异，建议根据自己的手机系统版本选择相应的操作方法，如有更多疑问，可咨询小米官方客服。